故事的主角陈博士，有着一段惨不忍睹的童年经历，他亲眼看到一个神秘的闪电球从窗外飘了进来，将他的父母烧成了灰烬。长大后，陈博士爱上了物理学，因为他想知道到底是什么力量造成了父母的惨剧。后来，陈博士到泰山参与了一个闪电研究项目，认识了一个叫林云的军人，林云给陈博士留下了深刻的印象。但是，陈博士发现林云研究球状闪电是想把它当成战争武器攻击敌军的航母或者坦克，这可是目睹双亲被闪电烧成灰烬的他不愿意接受的。可是陈博士最终还是顺从了林云。为了推导出球状闪电的数学模型，林云入侵了一个外国网站，后来被人家发现了并留言让她到俄罗斯的某个地方。当他们到达当地的球状闪电研究基地后，得知这里成功触发了27个球状闪电并电死了工程师的儿子。陈博士特别同情工程师，决定放弃研究球状闪电，于是和林云分道扬镳了。不久之后，珠峰号航空母舰的舰长江星辰找到了陈博士，让他阻止林云。陈博士被迫加入了球状闪电的研究基地，后来因为自己研究的球状闪电击杀了几十个被劫持的小学生，陈博士陷入了自责，最后离开了研究所。不久，战争爆发了，林云的球状闪电投入战场却没有杀死敌人。万念俱灰的林云强行开启宏原子核聚变实验，研究出威力更大的武器，她用生命结束了战争，令全世界为宏聚变武器的威力震惊，她自己也化成了量子态，向父亲吐露出内心的秘密。最终，陈博士和大学同学戴琳结了婚，可他的房间里面永远摆放着一个空花瓶，那里面是林云曾经为他插上的量子玫瑰。
